تُظهر دراسة الارتباط على مستوى الجينوم واسعة النطاق عبر حوالي 1600 عينة كيف يميز قياس الطيف الكتلي على مستوى الببتيد التغيرات البروتينية الحقيقية عن القطع الأثرية المحتملة للارتباط الناتجة عن الأساليب القائمة على التقارب، مما يجعل الدقة أساسًا للاكتشافات اللاحقة.

ريدوود سيتي، كاليفورنيا، 1 ديسمبر 2025 (جلوب نيوزواير) - أعلنت شركة Seer, Inc. (المدرجة في بورصة ناسداك تحت الرمز: SEER)، الرائدة والشريك الموثوق به في مجال التحليلات البروتينية المعمقة والموضوعية، اليوم عن نشر دراسة واسعة النطاق على مستوى الجينوم (GWAS) في مجلة Nature Genetics ، استخدمت فيها مجموعة منتجات ^{Proteograph®} لقياس البروتينات بدقة على مستوى الببتيدات ورسم خرائط محدداتها الجينية. وتُقدم هذه الدراسة، التي قادها الدكتور كارستن سوهري من كلية طب وايل كورنيل في قطر، بالتعاون مع باحثين من كلية الطب بجامعة هارفارد/مستشفى بريغهام والنساء، وشركة Seer، وشركة TruDiagnostic، أقوى دليل حتى الآن على أن التحقق من صحة قياس الطيف الكتلي ضروري لتحويل الإشارات الجينومية إلى أهداف دوائية موثوقة ومؤشرات حيوية سريرية. بدون التحقق من صحة قياس الطيف الكتلي، فإن ما يصل إلى ثلث ارتباطات البروتين بالجين التي تم الإبلاغ عنها بواسطة المقايسات القائمة على التقارب لا تتكرر، مما يسلط الضوء على ضرورة الدقة في علم البروتينات الجينومية.

شمل التحليل حوالي 1600 عينة دم تمثل خلفيات عرقية متعددة. تم تحليل مجموعة اكتشاف مكونة من 1260 عينة ومجموعة تكرار مستقلة مكونة من 325 عينة باستخدام برنامج بروتيوغراف من شركة سير. تم الكشف عن 5753 بروتينًا في هذه العينات، وتم قياس كمية 1980 بروتينًا منها لدى 80% على الأقل من المشاركين.

انطلاقاً من هذه البيانات، حدد الباحثون 364 موقعاً جينياً كمياً للسمات البروتينية (pQTLs) مرتبطة بوفرة البروتين. ومن بين هذه المواقع، تكررت 102 منها في مجموعة مستقلة. وكانت 35 من الإشارات المتكررة غير مُبلغ عنها سابقاً، مما يوسع نطاق المعلومات المتعلقة بالتنظيم الجيني للبروتينات.

استُخدمت الكواشف ذات الألفة في علم البروتينات لقياس مجموعة محددة مسبقًا من البروتينات في مجموعات كبيرة، وقد أسفرت عن آلاف من مواقع الارتباط الكمي البروتيني (pQTLs) المُبلغ عنها. ولكن عندما تُغير المتغيرات الجينية المُؤثرة على البروتين موقع ارتباط هذه الكواشف، قد تُسجل هذه الطرق إشارات خاطئة نتيجةً لضعف قوة ارتباط الكاشف بالبروتين. هذه التأثيرات، التي تُعرف بتأثيرات الإبيتوب، قد تُنتج ارتباطات ظاهرية بين التعبير البروتيني والمتغيرات الجينية لا تُمثل الواقع البيولوجي.

من خلال قياس البروتينات مباشرة على مستوى الببتيد، جعل نهج قياس الطيف الكتلي لجهاز Proteograph من الممكن اختبار ما إذا كان المتغير الجيني قد غير بالفعل التعبير البروتيني، مما يخفف من تأثير الإبيتوب المربك.

قال الدكتور سوهري: "أتاحت منصة بروتيوجراف إجراء تحليل البروتينات باستخدام مطياف الكتلة على نطاق واسع، بالعمق والدقة اللازمين لدراسات الارتباط الجيني. ومن خلال قياس البروتينات مباشرة على مستوى الببتيد، تمكنا من التمييز بين التأثيرات البيولوجية الحقيقية والنتائج الخاطئة في التحليل، مما أدى إلى رسم خريطة أكثر موثوقية تربط الجينات بالبروتينات وصولاً إلى مسارات الأمراض."

ولتوضيح النتائج، قارنت الدراسة نتائج قياس الطيف الكتلي مع اثنين من أكبر مصادر البروتينات القائمة على تقنية التقارب. وكشفت المقارنة عن نمط واضح:

• تم تأكيد وجود مواقع pQTLs التي تم الإبلاغ عنها باستمرار عبر منصات تقارب متعددة بواسطة قياس الطيف الكتلي.
  
• لم تتكرر النتائج التي توصلت إليها منصة تقارب واحدة، والتي تصل إلى ثلث الارتباطات، عند اختبارها بواسطة مطياف الكتلة.
  
  

"تُظهر هذه الدراسة أن التحليل القائم على قياس الطيف الكتلي أمر بالغ الأهمية في علم البروتينات"، كما صرّح الدكتور سيرافيم باتزوغلو، كبير مسؤولي البيانات في شركة سير. "من خلال توفير تأكيد على مستوى الببتيد على نطاق واسع، يُرسي جهاز بروتيوغراف قياسات البروتين التي تؤدي إلى اكتشاف ارتباطات جينية جديدة وتساعد في تحديد دقة تنبؤات pQTL القائمة على الألفة."

بالنسبة للباحثين الأكاديميين الذين يُجرون دراسات الارتباط على مستوى الجينوم (GWAS) ودراسات التوزيع العشوائي المندلي، فإن الرسالة واضحة: قد تحتوي مجموعات البيانات المبنية فقط على كواشف التقارب على نسبة كبيرة من الارتباطات التي لا تُمثل وفرة البروتين الحقيقية. وبدون التحقق من صحة هذه الارتباطات، فإن التحليلات اللاحقة تُخاطر باستخلاص استنتاجات سببية من نتائج زائفة ناتجة عن المستضدات.

في مجال اكتشاف الأدوية وتطوير المؤشرات الحيوية، يعزز التحقق على مستوى الببتيدات الثقة بأن الأهداف المختارة تمثل بيولوجيا حقيقية، وليست مجرد تشويش تقني. وتقلل الارتباطات الموثوقة من الجهد الضائع وتزيد من احتمالية ثبات نتائج الدراسات ما قبل السريرية في البيئات السريرية.

بالنسبة للبحوث الانتقالية، توضح الدراسة كيف يمكن استخدام قياس الطيف الكتلي وكواشف التقارب معًا، حيث يقوم قياس الطيف الكتلي بتصنيف مستوى موثوقية التنبؤات القائمة على التقارب.

بالنسبة للمرضى، تعني هذه الدقة احتمالية أكبر بأن تكون علاجات الغد مبنية على أسس بيولوجية حقيقية. وتساهم هذه العوامل مجتمعة في رسم مسار نحو خرائط جينية بروتينية شاملة وموثوقة.

يمثل هذا المنشور مرحلة التحقق. تقدم دراسة Nature Genetics أدلةً خاضعة لمراجعة الأقران على أن قياس الطيف الكتلي قادر على حلّ التشوهات بشكل منهجي وتأكيد أيّ الارتباطات قوية.

يكمن التحول في الإمكانيات التي يتيحها هذا النظام. فمع توسع نطاق علم البروتينات ليشمل أعدادًا أكبر من السكان، وتكامله مع علم الجينوم وعلم الأوبئة والسجلات السريرية، تعتمد فائدة هذه البيانات على دقتها. ومن خلال ربط الاكتشافات بتأكيدات على مستوى الببتيدات، يُمكّن نظام Seer علم البروتينات من أن يصبح علمًا جاهزًا للتطبيق على مستوى السكان، يدعم أهداف الأدوية والمؤشرات الحيوية والطب الانتقالي بالدقة اللازمة لتحقيق أثر سريري ملموس.

معلومات المقالة

العنوان: دراسة ارتباط على مستوى الجينوم لعلم البروتينات باستخدام مطياف الكتلة باستخدام منصة Seer Proteograph
المجلة: Nature Genetics ، نوفمبر 2025 (عبر الإنترنت)
المؤلفون: سوهري ك.، ولاسكي-سو ج.، وآخرون، بمن فيهم علماء مشروع سيير.

نبذة عن سير

تضع شركة Seer, Inc. (المدرجة في بورصة ناسداك تحت الرمز: SEER) معايير جديدة في مجال البروتينات المتعمقة وغير المتحيزة، حيث تقدم رؤىً ثاقبة على نطاق واسع وبسرعة ودقة وقابلية تكرار لم تكن متاحة سابقًا باستخدام طرق البروتينات الأخرى. تتميز مجموعة منتجات Proteograph من Seer بتكامل فريد يجمع بين الجسيمات النانوية المصممة هندسيًا، وأجهزة التشغيل الآلي المبسطة، والمواد الاستهلاكية المُحسّنة، وبرامج التحليل المتقدمة، وذلك لحل التحديات التي عجزت الطرق التقليدية عن التغلب عليها. لطالما عانت تقنيات البروتينات التقليدية من بيانات غير متسقة، وإنتاجية محدودة، وتعقيد بالغ، إلا أن سير عمل Seer القوي والقابل للتطوير يكشف باستمرار عن رؤى بيولوجية لا يكشف عنها الآخرون. منتجات Seer مخصصة للاستخدام البحثي فقط، وليست مخصصة لإجراءات التشخيص. لمزيد من المعلومات حول نهج Seer المتميز وريادتها المستمرة في مجال البروتينات، تفضل بزيارة الموقع الإلكتروني www.seer.bio .

للتواصل الإعلامي:
باتريك شميدت
pr@seer.bio

للتواصل مع المستثمرين:
كاري مينديفيل
investor@seer.bio

تتوفر صورة مرفقة بهذا الإعلان على الرابط التالي: https://www.globenewswire.com/NewsRoom/AttachmentNg/ae65f47f-3263-4c92-ae93-f0f8d4ea62e4